Nấu nước dùng. Cá sau khi sơ chế xương và đầu cá bỏ vào nồi đổ đầy nước ninh nhừ, nêm gia vị, thêm ít cọng hành tươi, thì là, đun sôi lại, làm nước để chan. Phần thịt cá cắt mỏng, ướp với gia vị, bột ngọt, bột nghệ, khoảng 20 phút. Cho vào chảo rán vàng rồi vớt ra đĩa. Rau cần nhặt bỏ rễ, rửa sạch, đem cắt khúc. Khi ăn đun sôi nước dùng, trụng bún qua nước sôi rồi xếp vào tô, cho cá, rau lên mặt và dùng nóng. Nêm bún bằng nước mắm ngon  mới đúng điệu, làm tăng hương vị tô bún cá và có thể vắt chanh tuỳ thích.